Et afsnit inden for genetik er et DNA-molekyle, der er i stand til at replikere autonomt i værtscelleens cytoplasma, og som fysisk integreret i værtscelleens kromosom, også replikeres som et enkelt molekyle (ved som vi kalder cointegrated).
Episoden kan derfor fortolkes som en form for sameksistens og ikke som en type replikon. Faktisk kan transposoner og insertionssekvenser for nogle forfattere betragtes som episoder, da de effektivt bæres på værtscellens kromosom, skønt de aldrig har en uafhængig og autonom eksistens i cytoplasmaet.
I eukaryote celler, derimod, refererer episome mere til virale replikoner, der sameksisterer som plasmider i inficerede celler end til vira, der kan integreres i værtscellens genom.
Dette er ikke det eneste tilfælde, hvor det samme ord betyder forskellige ting i eukaryoter og prokaryoter (for eksempel betegnelsen transformation). Episoder har en rig historie i udviklingen af moderne genetik, da de hjalp med til at afsløre interessante fænomener relateret til arvelighed.
Episoder, der er bakteriofager
Et andet af de bedst kendte eksempler på episoder er det med fertilitetsfaktoren eller plasmid F. Nogle gange rekombineres det cirkulære plasmid, afhængigt af nukleotidsammensætningen af værtsbakterien (fx E. coli), med homologe steder til stede på kromosomet. af bakterien, der giver anledning til et cointegrat.
Det vil sige, at plasmidet kan replikere i et lavt kopietal i cytoplasmaet af bakterien, eller hvis det er integreret, replikeres som en helhed i et kopienummer svarende til det for bakterien uden F (generelt en).
I sin episomstilstand giver F bakterierne evnen til at producere et stort antal rekombinanter efter konjugeringsprocessen.
En F + -bakterie (det vil sige, der har et autonomt F-plasmid), der gennemgår indsættelsen af dette element siges at være Hfr (for høj frekvens af rekombination, for dets akronym på engelsk), da det på grund af en konjugeringshændelse er teoretisk i stand til at "trække" hele bakteriekromosomet ind i en F-bakterie (dvs. mangler fertilitetsfaktoren eller plasmid F).
Generelt er sekvenserne, der tilvejebringer homologien (og derfor lighed og komplementaritet) mellem F-plasmidet og bakteriekromosomet, således at den stedspecifikke rekombinationsproces, der giver anledning til cointegratet, verificeres, insertionssekvenser.
Episoder i eukaryote celler
Af historiske grunde var udtrykket episome (over + krop) altid knyttet til det for plasmid, som oprindeligt stammer fra verdenen af ekstrakromosomale elementer i prokaryoter.
Når man finder lignende elementer i eukaryoter, blev anvendelsen af det samme vedtaget til at betegne molekyler af virusgenomer, der var i stand til at selvreplikere i denne type inficerede celler med egenskaber, der svarede til plasmiderne i prokaryoter.
Det vil sige, i eukaryotiske celler, der er inficeret med vira, kan vi i nogle tilfælde finde ud af, at virussen som en del af dens replikative cyklus eksisterer i cellen som et cirkulært DNA-molekyle svarende til disse andre replikoner beskrevet i for eksempel bakterier.
De mest almindeligt kendte vira, der kan sameksistere som autonomt replikerende cirkulære DNA-molekyler (fra værtskromosomet) hører til familierne Herpesviridae, Adenoviridae og Polyomaviridae.
Ingen af dem er imidlertid integreret i værtsgenomet, hvorfor det kan overvejes, at de replikeres som plasmider, og at de ikke opfylder den iboende kvalitet, der kendetegner et episom: integreres i værtsgenomet.
Selvom fjernelsen af begrebet er blevet foreslået, vil det måske kun tilføje forvirring til et emne, der allerede er ret kompliceret i sig selv.
konklusioner
I sammendraget kan vi sige, at et episom, etymologisk set, er et genetisk element i autonom replikation, der kan sameksistere i cellen som et frit DNA-molekyle eller fysisk integreret i værten.
Fra genetisk synspunkt er et episom imidlertid et plasmid eller en virus, der kan integreres i genomet af prokaryoter, eller være en af de typer plasmider, som en eukaryot celle kan rumme.
Interessant nok betragtes vira, der kan indsætte i genomet til den eukaryote vært (retrovirus), ikke som episoder.
Referencer
- Brock, TD 1990. Emerging of Bacterial Genetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, MA, Amerikas Forenede Stater.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. Introduktion til genetisk analyse. WH Freeman & Co, McMillan forlag. London, Storbritannien.
- Hayes, W. 1971. Genetik af bakterier og deres vira, anden udgave. Blackwell Scientific Publications.
- Jacob, F. & Wollman, EL 1958. Les episoder, elementer génétiques ajoutés. Kommer Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Virology, 3. udgave. Prentice Hall. Englerwood Cliffs, NJ, Amerikas Forenede Stater.